Tuotteet

Ihmisen referenssigenomisekvenssi loi pohjan tutkimuksille geneettisestä variaatiosta ja sen yhteydestä ihmisen sairauksiin, mutta epigenomisista tutkimuksista puuttuu samanlainen viite.Vastatakseen tähän tarpeeseen NIH Roadmap Epigenomics Consortium loi tähän mennessä suurimman kokoelman ihmisen epigenomeja primaarisoluille ja kudoksille.Tässä kuvataan ohjelman osana luodun 111 ihmisen vertailuepigenomin integroivaa analyysiä, joka on profiloitu histonien modifikaatiomallien, DNA:n saavutettavuuden, DNA:n metylaation ja RNA:n ilmentymisen suhteen.Luomme globaaleja karttoja säätelyelementeistä, määrittelemme koordinoidun toiminnan säätelymoduulit ja niiden todennäköiset aktivaattorit ja repressorit.Osoitamme, että tauteihin ja piirteisiin liittyvät geneettiset variantit ovat rikastuneet kudosspesifisillä epigenomisilla merkinnöillä, paljastaen biologisesti merkityksellisiä solutyyppejä erilaisille ihmisen ominaisuuksille ja tarjoavat resurssin ihmisen sairauden molekyyliperustan tulkitsemiseen.Tuloksemme osoittavat epigenomisen tiedon keskeisen roolin geenisäätelyn, solujen erilaistumisen ja ihmisen sairauksien ymmärtämisessä.